Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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