Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms