Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CKAP5Q14008 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CKAP5Q14008 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CKAP5Q14008 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CKAP5Q14008 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CKAP5Q14008 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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