Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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