Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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