Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TCOF1Q13428 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCOF1Q13428 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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