Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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