Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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