Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms