Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL39P62891 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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