Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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FAM3BP58499 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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