Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AIF1P55008 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AIF1P55008 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms