Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms