Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA2P51531 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms