Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD13P35453 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms