Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFNP31947 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFNP31947 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFNP31947 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFNP31947 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFNP31947 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFNP31947 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFNP31947 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFNP31947 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFNP31947 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFNP31947 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFNP31947 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFNP31947 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFNP31947 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms