Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms