Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms