Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms