Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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