Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RAB23Q9ULC3 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RAB23Q9ULC3 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB23Q9ULC3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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