Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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