Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms