Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF17Q9BXT8 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms