Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAT1Q99536 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAT1Q99536 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAT1Q99536 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAT1Q99536 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAT1Q99536 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms