Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM43Q96BQ3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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