Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A3Q93084 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms