Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms