Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPPQ6IPU0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms