Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms