Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB6CQ53S08 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms