Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms