Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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