Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms