Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms