Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE4BQ07343 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms