Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms