Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TRPC5OS-202ENST00000612026 1043 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC005609.5-202ENST00000624176 513 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC026765.2-201ENST00000551875 1330 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL157902.2-201ENST00000623435 1492 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 NOVA1-201ENST00000344429 896 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL137220.1-201ENST00000431369 661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC013652.1-206ENST00000558277 789 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL357143.2-201ENST00000640266 421 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC022748.2-203ENST00000564933 1432 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms