Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM3Q01628 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms