Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms