Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms