Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms