Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CREB1P16220 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CREB1P16220 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CREB1P16220 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CREB1P16220 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms