Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms