Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CCNDBP1O95273 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CCNDBP1O95273 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CCNDBP1O95273 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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