Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRTO14522 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRTO14522 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms