Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms