Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms