Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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