Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms